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Em 2010, tendo a visão da importância de uma infância saudável para uma sociedade melhor, o Dr. José Luiz instituiu a Fundação José Luiz Setúbal, comprometida com a missão de promover a saúde infantil por meio da assistência, desenvolvimento de pesquisas e disseminação do conhecimento. Alinhado a este propósito, dois anos mais tarde, foi criado o Instituto Pensi – Sandra Mutarelli Setúbal, um centro gerador, tradutor e difusor do conhecimento científico para profissionais da saúde, educadores, famílias e sociedade em geral.
A Fundação José Luiz Setúbal foi instituída pensando em sua perenidade. Parte do patrimônio instituidor foi o Sabará Hospital Infantil, que no modelo idealizado é o gerador de recursos financeiros para a Fundação. Os recursos devem, a critério do Conselho Superior, ser depositados em um Fundo Patrimonial, e deste uma porcentagem será alocada para o Instituto Pensi realizar a missão da Fundação, ou seja, produzir, traduzir e disseminar conhecimento científico em saúde infantojuvenil.
O Instituto Pensi – Sandra Mutarelli Setúbal possui estrutura própria, mas atua em colaboração contínua com o Sabará Hospital Infantil e o Instituto Infinis, que juntos compõem o ecossistema da Fundação José Luiz Setúbal.